Mеханико-математический факультет 
Факультет вычислительной математики и кибернетики 
Физический факультет 
Химический факультет 
Факультет наук о материалах 
Биологический факультет 
Факультет фундаментальной медицины 
Факультет биоинженерии и биоинформатики 
Факультет почвоведения 
Геологический факультет 
Географический факультет 
Исторический факультет 
Филологический факультет 
Факультет иностранных языков и регионоведения 
Философский факультет 
Социологический факультет 
Экономический факультет 
Юридический факультет 
Факультет журналистики 
Факультет психологии 
Институт стран Азии и Африки 
Факультет государственного управления 
Высшая школа бизнеса 
Факультет искусств 
Московская школа экономики 
Факультет глобальных процессов 
Факультет мировой политики 
Высшая школа перевода 
Физико-химический факультет 
Школа управления и инноваций 
Факультет дополнительного образования 
Факультет фундаментальной медицины (ординатура)