1) Забор воды на промышленные и бытовые нужды приводит к истощению водных ресурсов 
2) Загрязнение стоками. Точечные источники опаснее площадных. Точечные - это трубы, по которым загрязненная вода поступает в реки, площадные - сток с сельхозполей в основном 
Загрязняющие вещества могут быть токсичными или биогенными (т. е. азот и фосфор) 
3) Нарушение правил строительства в водоохранных зонах рек 
4) Свалки отходов (так бытовых, так и промышленных)