Единственный охраняемый природный объект федерального значения - это Кирзинский заказник. Расположен он в Барабинском и Чановском районах, на его территории обитает более 2500 видов животных, из них около 250 видов птиц (удоды, сапсаны, беркуты и др.), 50 видов млекопитающих (рыси, косули, зайцы, лоси, горностаи и др.), а также беспозвоночные, рыбы, земноводные и другие. Одной из целей создания этого заказника является сохранение и восстановление популяции редких видов животных и растений. На территории заказника расположено более 50 озёр, в том числе самое крупное озеро НСО - Чаны.

Помимо этого заказника в Новосибирской области есть ещё несколько заказников областного значения. Вот их перечень:

Кроме того, в Новосибирской области есть несколько памятников природы, а также местности, где планируется создать природные заказники.

Подробно о каждой из этих охраняемых природных территорий можно прочитать на сайте