Сам Булгаков принимал непосредственное участие в революции: служил военным врачом и у красных, и у белых. Грозные события застали Булгакова под Смоленском, в вяземской городской больнице. С 1918 по 1919 г. у Булгакова проходит частная практика в Киеве, где он вновь оказывается в гуще гражданской войны, видит неоднократную смену власти, мужественно переносит мобилизацию петлюровцами, участвует вместе с братьями в защите Киева. В 1919г. , вновь мобилизованный белыми, он оказывается на Северном Кавказе.

Но постепенно его отношение к революции, как к событию принесшему стране разруху и несчастье, становилось все негативнее.