Главной темой стиха является одиночество (как и во многих других произведениях Лермонтова): "Белеет парус одинокий".
В строчках:"Что ищет он в стране далекой? 
Что кинул он в краю родном?... " мы видим задумчивость автора и его философское настроение. 
"Играют волны — ветер свищет, 
И мачта гнется и скрыпит... "-здесь мы видим тревогу, предчувствие чего-то плохого.
"Увы! Он счастия не ищет 
И не от счастия бежит! " - а в этих строках автор показывает зависимость паруса от каких-то факторов: он не имеет точной цели.
В стихе присутствует нота отчаяния: "Под ним струя светлей лазури, 
Над ним луч солнца золотой... 
А он, мятежный, просит бури, 
Как будто в бурях есть покой! " Т.е.  луч солнца и светлая вода - эта спокойная красота не приносят счастья. Парусу нужна буря, как освобождение от мыслей, как фееричный конец.
Вообще настроение стиха пессимистичное. Я бы назвала это отрицанием гармонии и спокойствия.