Алый и красный,действительно, синонимы. Но "красный"из уст толпы Зурбагана и трактирщика звучит как-то насмешливо и даже враждебно;""алый"" используют в своей речи Ассоль, Грей и другие положительные персонажи феерии, значение этого слова возвышенно и романтично, прекрасно, как сама история об алых парусах.

Это противопоставление словно разделяет людей, верящих в чудеса, и толпу,смеющуюся над мечтой.

Особого различия между красным и алым нет.Эти слова являются синонимами.Это противопоставление означает,что автор в случае употребления слова "алый" хотел сделать выразительной речь героя,произносившего это слово.