Промышленное освоение территории началось в XVIII веке. В 1700 году построен Нерчинский серебросвинцовый завод, а к концу XVIII века здесь уже работало 9 заводов, в том числе Петровский чугунолитейный и железоделательный. Активно развивалась олово и золотодобыча.

Укрепившись в Забайкалье, русские служилые люди стали притеснять бурятское население, захватывая их земли. В 1702 году хоринские буряты вынуждены были отправить в Москву делегацию, возглавляемую зайсаном галзатского рода Баданом Туракиным, с челобитной Петру I. Встретившись с делегацией, Петр I 22 марта 1703 года издал указ и приказал "свесть служилых и сяких чинов людей по другую сторону Селенги: чтоб им иноземцам от их налог и обид вконец не разоритца".

21 октября 1727 году усилиями графа Саввы Владиславича-Рагузинского, по высочайшему повелению, между Россией, Китаем и Монголией был заключен Буринский трактат, согласно которому земли, занимаемые бурятами, отошли к России. Была сделана демаркационная линия границы передвижение по ней прекратилось, и буряты окончательно закрепились как подданные России.

Согласно Высочайшего Указа, данного Правительствующему Сенату 11 июля 1851 года Забайкалье, состоявшее из двух округов - Верхнеудинского и Нерчинского, было выделено из Иркутской губернии и преобразовано в самостоятельную область, причем Чита возведена в областной город, а Троицкосавск, Кяхта и Усть-Кяхта составили особое градоначальство. Пограничные казаки, Забайкальский городовой казачий полк, станичные казаки, тунгусский и бурятские полки, а также и население, жившее оседло в пограничной полосе, составили Забайкальское казачье войско, обязанное выставлять 6 конных шестисотенных полков.

В 1884 году область, прежде принадлежавшая к Восточно-Сибирскому генерал-губернаторству, вошла в состав вновь образованного Приамурского генерал-губернаторства. 17 марта 1906 года Забайкальская область вошла в состав Иркутского генерал-губернаторства.