Процесс принятия российского подданства частью казахов Младшего и Среднего жузов в основном имел далеко идущие негативные последствия. Казахский народ постепенно стал терять свою независимость. Царизм со временем стал превращать ханов и султанов в своих послушных чиновников. Сознательный отказ царизма признавать общеказахского хана привел к началу территориальной раздробленности и разрушению единства Казахского государства. Практически без согласования с казахскими правителями началось усиленное строительство военных крепостей, форпостов и редутов по всей казахско-российской границе. Сокращение пастбищных угодий привело к существенному подрыву основ кочевого и полукочевого скотоводческого хозяйства. В годы джутов местное население лишилось возможности свободно перекочевывать в приграничные регионы с целью спасения скота. Вхождение Казахстана в сферу российского влияния в последующем вызвало и некоторые ухудшения отношений казахов со среднеазиатскими государствами. Они выразились в усилении военных набегов войск ханов Хивы и Бухары на население Южного Казахстана, в установлении налогов и т. д. В то же время усиление торговых связей между Россией и Казахстаном имело и некоторый позитивный характер. Началось изучение Казахстана российскими учеными. Всё это привело к обострению земельного вопроса.