устаревшая армия, да и вообще людей, способных воевать мало было. регулярная армия вообще отсутствовала
у страны не было денег  для ведения длительной войны
к тому же, России приходилось воевать не только на западных рубежах, но и на севере и юге (с крымцами и ногайцами)
да и дипломатия Ивана грозного никакой была, очень плохая вобщем. из за этого России пришлось еще и с Речью Посполитой и со Швецией воевать.