Цитата Из Вик.ипедии: "Правило шифрования 'Атбаш' состоит в замене i-й буквы алфавита буквой с номером n - i + 1, где n — число букв в алфавите".

На самом деле, n - i — смещение относительно первой буквы, которое будет иметь i-тая в алфавите буква после шифровки. Для того, чтобы получить номер буквы, нужно прибавить к смещению порядковый номер первой буквы. В случае с обычным алфавитом — 1. (А ещё можно делать наоборот: искать отрицательное смещение и прибавлять номер последнего элемента)

С программой все чуть-чуть посложнее (но не так, чтобы сильно). Номер символа в ней определяется не положением в алфавите, а используемой кодировкой. Обычно, символы идут в таблице кодировки друг за другом, но есть и исключения. Например, буква "ё" обычно идет отдельно от остального алфавита.

Программа читает стандартный ввод (клавиатура) построчно.
Если буквы латинские, достаточно простой арифметики с кодами символов и перевод результата в символьных формат.
Для русских символов выделена переменная, содержащая алфавит в правильном порядке (хотя можно было бы извернуться и решить первым способом, но зачем?). Если символ подходит входит в один из двух алфавитов, то шифруется. Нет - выводится без изменений.

Программа будет работать до тех пор пока не будет введен символ с кодом 0 (Ctrl + @).

//////////////////////////////
using System;
using System.Collections.Generic;
using System.Linq;
using System.Text;
namespace Brainly {
    class Program {
        static void Main(string[] args) {
            string buff,
                alfa = "абвгдеёжзийклмнопрстуфхцчъыьэюя", //алфавит
                key = new string(alfa.ToCharArray().Reverse().ToArray());//перевернутый алфавит
            bool isEnd = false;
            while (!isEnd) {
                Console.Write("Введите текст: ");
                buff = Console.ReadLine();
                Console.Write("Результат:     ");
                for (int i = 0; i < buff.Length; ++i) buff[i] == 'ё')
                        Console.Write(key[alfa.IndexOf(buff[i])]);
                    else if (buff[i] >= 'А' && buff[i] <= 'Я'
                Console.WriteLine();    Console.WriteLine();
            }
        }
    }
}