1. "Школьное" решение

// PascalABC.Net 3.0, сборка 1066
var
  s,s1:string;
  i:integer;
  a:char;
begin
  Write('Введите натуральное число любой длины :'); Readln(s);
  Write('Введите цифру, которую надо удалить: '); Readln(a);
  s1:='';
  for i:=1 to Length(s) do
    if s[i]a then s1:=s1+s[i];
  Writeln('Результат: ',s1)
end.

Тестовый прогон:
Введите натуральное число любой длины :3141592653589793
Введите цифру, которую надо удалить: 5
Результат: 3141926389793

2. Современное решение (так в школе почему-то не учат)

// PascalABC.Net 3.0, сборка 1066
begin
  var s:=ReadString('Введите натуральное число любой длины :');
  var a:=ReadChar('Введите цифру, которую надо удалить: ');
  Write('Результат: ',s.Replace(a,''));
end.