Водохранилище снабжает технической водой ТЭЦ-3 и шестнадцать предприятий города. Отклонение от проектного режима эксплуатации Чижовского водохранилища, а также нерегламентированный сброс недостаточно очищенных сточных вод привели к снижению водообмена, изменению гидрохимического и теплового режимов, повышению концентрации загрязняющих веществ. Сильно загрязнен ил, содержание бензопирена превышает предельно допустимую концентрацию (ПДК) в 40 - 50 раз, фенолов - в тысячу. Во многих пробах зафиксировано превышение ПДК по тяжелым металлам, по хрому, в частности, в тысячу раз.