В соответствии с современным законодательством (НК РФ и Конституция РФ) формой законодательной деятельности мэра являются постановления (которые носят нормативных характер) и распоряжения (носят индивидуально-определенный характер). В данном случае глава администрации попытался своим постановлением, которое распростроняется на неопределенный круг субъектов попытался освободить от налоговой обязанности (установленной п.1 ст. 3 Налогового кодекса) конкретное лицо (в данном случае - предприятие А.). Если глава и хотел освободить предприятие, то должен был издавать распоряжение. Следовательно, представление, вынесенное прокуратурой обоснованно.
Установление налоговой льготы для всех категорий налогоплательщиков недопустимо, т.к. это противоречит принципу, закрепленному в п. 5 ст 3 НК РФ: "Ни на кого не может быть возложена обязанность уплачивать налоги и сборы, а также иные взносы и платежи, обладающие установленными настоящим Кодексом признаками налогов или сборов, не предусмотренные настоящим Кодексом". Так как такая налоговая льгота не предусмотрена в НК, то и нормативно устанавливать ее нельзя (можно только для конкретной организации).