Основные задачи общей экологии: исследование связей в экосистемах, оценка их состояния, исследование процессов протекающих в биосфере, с целью поддержания устойчивости ее, моделирование состояния экосистем и глобальных биологических процессов.
Основные прикладные задачи, которые экология должна решать в настоящее время следующие:
прогнозирование и оценка возможных отрицательных последствий в окружающей среде под влиянием деятельности человека;охрана окружающей среды;сохранение, воспроизводство и рациональное использование природных ресурсов.