Закисление озер опасно для популяций различных видов рыб (в том числе лососевых, сиговых и др.), а также часто влечет за собой постепенную гибель планктона, многочисленных видов водорослей и других его обитателей. Озера становятся практически безжизненными.

В «закисленных» водоемах (за счет вымывания из почвы) высоки концентрации иона алюминия, опасного для живых организмов.

При закислении водоемов нарушаются микробиологические процессы; доминировавшие бактерии и простейшие уступают место грибам.

В связи с закислением водоемов и состоянием водной биоты возникает необходимость в учете многообразных факторов — геохимических условий отдельных регионов, кислотности осадков и качества почв, выживаемости организмов гидрологических режимов.

Спасать природу от закисления необходимо. Для этого придется резко снизить выбросы в атмосферу окислов серы и азота, но в первую очередь сернистого газа, так как именно серная кислота и ее соли на 70-80% обуславливают кислотность дождей, выпадающих на больших расстояниях от места промышленного выброса.