Долина реки Сетунь — самый большой природный заказник, находящийся в черте Москвы. Природоохранная зона, расположенная вдоль акватории реки Сетуни. По территории города река протекает в Западном административном округе.

Создан в 1998 году. Площадь заказника составляет 693,2 гектара

Целями создания заказника являются сохранение историко-культурных и природных комплексов, ценных объектов и территорий, являющихся ареалами редких видов растений, животных, птиц и насекомых, уязвимых в городских условиях или находящихся под угрозой исчезновения; выполнение научно-исследовательских работ; поддержание рекреационного потенциала городских территорий; восстановление нарушенных ландшафтов, биогеоценозов, природных, исторических и культурных объектов; а также экологическое просвещение населения

На склонах речной долины произрастают берёзовые, дубовые, липовые и сосновые участки лесов, сменяющиеся ивняками и сероольшанниками. Прибрежные луга чередуются с низинными болотцами.

Флора заказника представлена 384 видами сосудистых растений, из них 47 относятся к редким для Москвы. Встречаются ландыш майский, ежеголовник малый, первоцвет весенний, колокольчики, орхидеи и другие растения Красной книги Москвы. Из представителей фауны можно увидеть ласку, горностая, водяную котору и ондатру

К категории редких для города можно отнести 41 вид позвоночных, обитающих в заказнике. В долине Сетуни зарегистрировано 5 видов земноводных, 69 видов пернатых, 62 из которых гнездятся на данной территории, и 18 видов млекопитающих.

В границах особо охраняемой природной территории расположен родник в основании правобережного склона долины реки Сетуни, являющийся памятником природы

Обеспечение охраны и функционирования заказника возложено на Департамент природопользования и охраны окружающей среды города Москвы

Наиболее крупные местные лесные массивы - Волынский и Матвеевский - состоят преимущественно из сосен, лип и берёз, хотя в них представлены и ели с ольхами, просто в значительно меньшей степени.

Из прочих растительных видов, которые обладают первоочередной важностью для природы заказника Долина реки Сетунь, стоит назвать произрастающие здесь ландыши, ирисы и колокольчики. Среди охраняемых животных видов заказника Долина реки Сетунь проживают горностай, ласки и зайцы. Помимо них на территории заказника проживают и прочие не менее примечательные животные виды: белки и кроты. Среди пернатых заказника особой важностью обладают дрозды и снегири, хотя больше других ценятся местные жители ястреба, тетеревятники, вороны, жаворонки, коростели и проч. Из обитателей местной ихтиофауны стоит выделить речных жителей: плотву, карася, щуку и окуня.