Нити гриба(верхняя и нижняя кора, слой микобионта): защита фикобионта(слой водорослей или цианобактерий) от внешний раздражителей, погодных условий, функция прикрепления к субстрату;
нити гриба(сердцевина): рыхло расположенные гифы гриба, служат для терморегуляции, поддержания постоянной температуры, давления, проветривания;
слой водорослей/цианобактерий: фотосинтез.
также лишайники размножаются специальными образованиями, состоящими из клетки водоросли/цианобактерии, оплетенной гифами гриба.