Бактерии питаются готовыми органическими веществами, отмерших остатков животного или растения, или за счет соков своего хозяина .

Большинство бактерий питаются готовыми органическими веществами, т. е. являются гетеротрофами. Некоторые из них питаются останками погибщих организмов . Эти бактерии называют сапрофитами. Сапрофитные бактерии учавствуют в разложении мёртвых останков, в превращении молока в кефир, в квашении капусты.
Кроме того существуют бактерии обитающие в различных тканях растений, животных и человека, вызывающие различные заболевания. Такие бактерии называются бактериями-паразитами.
Есть и бактерии в которых под действием солнечной энергии проходит процесс фотосинтеза, то есть они являются автотрофами.