Смотря какая ящерица?? 
у зеленых игуан, парусных и водяных ящериц, а также василисков самцы украшены выраженным гребнем на спине и голове. У самцов агам помимо гребня имеются особые поры на задней поверхности бедра. У представителей многих видов хамелеонов есть аналогичные образования – небольшие кожные выросты. «Мужской» атрибут у ящериц большинства видов – пяточные шпоры.Если вы завели анолиса, определить пол можно по наличию горловых мешков и двух увеличенных чешуек позади клоаки (у самцов). Ядозубы-самки имеют два прямоугольных преанальных щитка, а самцы – четыре. У гекконов отличительным признаком самцов служат преанальные поры, - впрочем, это характерно для анолисов, агам, игуан, заборных ящериц, настоящих ящериц и американских варанов. Однако, такая затея как определить пол ящерицы по размерам бедренных и преанальных пор не всегда увенчается успехом. Дело в том, что они обладают свойством изменять размер в зависимости от времени года.