Низкоорганизованные плесневые грибы могут являться  причиной болезней культурных сельскохозяйственных и лесных растений, животных и человека. Они поражают пищевые продукты, строительные материалы, промышленные изделия.

В то же время низшие грибы весьма полезны. Они широко применяются в медицине, ветеринарии, играют большую роль в защите растений от вредителей и болезней.

Целый ряд плесневых грибов служит источником получения пенициллина, спасшего уже миллионы человеческих жизней.