Гипоталамус контролирует деятельности эндокринной системы человека, благодаря тому, что его нейроны способны выделять нейроэндокринные трансмиттеры (либерины и статины), стимулирующие или угнетающие выроботку гормонов гипофизом. Является центром регуляции эндокринных функций , он объединяет нервные и эндокринные регуляторные механизмы в общую нейроэндокринную систему.