По-моему 3 нужно подставить в квадратное уравнение вместо X, и при таком исходе результат выйдет <=0

В вашем неравенстве слева  стоит выражение с переменной. Вам надо найти все значения этой переменной Х, при которой выполняется условие ≤0
После всех вычисление Вы получили х=3, при котором выражение в левой части становится равным нулю.
если бы стояло неравенство х≤0,  тогда  х=3 не подходит, но у Вас
(х-3)(х-3)≤0,  подставляем х=3 и получим (3-3)(3-3)≤0 , 0≤0 - верно!